此合作夥伴解決方案將 Illumina DRAGEN (基因體學動態讀取分析) Bio-IT Platform 部署到 Amazon Web Services (AWS)。
DRAGEN Bio-IT Platform 可以對下一代定序 (NGS) 資料進行超快速分析，大幅縮短分析基因組資料所需的時間，並提高準確性。它包括生物資訊學管道，為映射、比對、分類、重複標記和單倍型變體呼叫提供優化的演算法。這些管道包括生殖細胞、體細胞 (腫瘤和腫瘤/正常細胞)，RNA、單細胞 RNA、甲基化、聯合基因分型和 DRAGEN-GATK。
此合作夥伴解決方案可建立跨兩個可用區域的 AWS 環境以提供高可用性，以及為 Spot 執行個體和隨需執行個體佈建兩個 AWS Batch 運算環境。這些環境包括 DRAGEN F1 執行個體，可連接現場可程式化閘道陣列 (FPGA) 以進行硬體加速。
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您將建置的項目
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部署方式
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成本和授權
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您將建置的項目
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使用此合作夥伴解決方案，在 AWS 上設定下列可設定的環境：
- 跨越兩個可用區域的高度可用的架構。*
- 根據 AWS 最佳實務，設定公有和私有子網路的虛擬私有雲端 (VPC)。這可為您的部署提供網路基礎設施。*
- 提供網際網路存取的網際網路閘道。*
- 在公有子網路中，設定受管 NAT 閘道以允許對私有子網路資源進行傳出網際網路存取。*
- 設定 AWS CodePipeline 管道，以建立 Docker 映像並將其上傳到 Amazon Elastic Container Registry (Amazon ECR) 儲存庫。
- 兩個 AWS Batch 運算環境：一個用於 Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) Spot 執行個體，另一個用於隨需執行個體。
- 設定 AWS Batch 任務佇列以優先處理提交到 Spot 執行個體運算環境的項目，以優化成本。
- 用於執行 DRAGEN 的 AWS Batch 任務定義。
- AWS Batch 任務要執行的 AWS Identity and Access Management (IAM) 角色和政策。
* 可將合作夥伴解決方案部署至現有 VPC 的範本，會略過標有星號的元件，並提示您輸入現有的 VPC 組態。
- 跨越兩個可用區域的高度可用的架構。*
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部署方式
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要部署 Illumina DRAGEN，請按照部署指南中的說明進行操作。部署程序包括以下步驟：
- 如果您尚未擁有 AWS 帳戶，請在 https://aws.amazon.com 註冊。
- 在 AWS Marketplace 中訂閱 DRAGEN Bio-IT Platform。
- 啟動合作夥伴解決方案。每個部署的時間約 15 分鐘。您可以從兩個選項中進行選擇：
- 執行 DRAGEN 任務來測試部署。
要自訂部署，請設定網路架構、為 AWS Batch 環境設定所需的虛擬 CPU 數量、指定 Spot 執行個體的出價百分比，以及設定 AWS Batch 任務重試次數。
Amazon 可能會與 AWS 合作夥伴 (與 AWS 在此解決方案上協作的合作夥伴) 分享使用者部署資訊。
- 如果您尚未擁有 AWS 帳戶，請在 https://aws.amazon.com 註冊。
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成本和授權
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本合作夥伴解決方案需要訂閱 DRAGEN Bio-IT Platform 的 Amazon Machine Image (AMI)，您可以在 AWS Marketplace 訂閱並按小時支付使用費。
執行此解決方案時，您須自行支付使用 AWS 服務和任何第三方授權的相關費用。使用此解決方案無須額外付費。
此解決方案包括您能自訂的組態參數。其中某些設定 (例如執行個體類型) 會影響到部署的成本。若要估算成本，請參閱您所使用每項 AWS 服務的定價頁面。定價可能會隨時變更。
提示：在部署解決方案後，建立 AWS Cost and Usage Report 以追蹤相關成本。這些報告會向您帳戶中的 Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) 儲存貯體提供各個帳單指標。它們會根據每個月的用量提供成本估算，並在月底彙總資料。如需詳細資訊，請參閱 什麼是 AWS Cost and Usage Report？
