Amazon Genomics CLI

Procese de manera fácil y eficiente los datos sin procesar genómicos y biológicos en la nube a escala de petabytes.

Con unas pocas líneas de comandos, puede configurar motores de flujo de trabajo como Cromwell y Nextflow en AWS en cuestión de minutos sin cambiar el código existente ni modificar las herramientas de genómica de código abierto.

Automatice las tareas demandantes, como la configuración y la implementación de motores de flujo de trabajo, la creación de políticas de acceso a los datos y el ajuste de clústeres de computación para que funcionen a escala.

Ejecute flujos de trabajo de datos de genómica a mayor escala y en menos tiempo, lo que reducirá el tiempo para adquirir información útil, como la identificación de variantes y el diagnóstico de enfermedades.

Funcionamiento

Amazon Genomics CLI es una herramienta de código abierto para los clientes de genómica y ciencias biológicas que simplifica y automatiza la implementación de infraestructura en la nube, lo que le brinda una interfaz de línea de comandos fácil de usar para configurar y ejecutar rápidamente flujos de trabajo de genómica en Amazon Web Services (AWS), especificados por lenguajes como WDL. Al eliminar el trabajo pesado de configurar y ejecutar flujos de trabajo de genómica en la nube, los desarrolladores de software y los investigadores pueden aprovisionar, configurar y escalar automáticamente los recursos de la nube para permitir, entre otros, estudios genéticos a nivel de población y ciclos de descubrimiento de fármacos más rápidos y más rentables.

Casos de uso

Medicina de precisión

Se habilita el análisis de datos de la secuenciación genómica y se utilizan los hallazgos en un entorno clínico para mejorar la salud de las personas. A nivel de la población, se identifican los grupos que son susceptibles a desarrollar un determinado problema de salud o a ser portadores durante un brote de patógenos.

Descubrimiento y desarrollo de fármacos

Se aprovecha la genética humana y el conocimiento de las funciones de los genes para permitir el desarrollo de tratamientos preventivos y el descubrimiento de fármacos nuevos.

Genómica ambiental

Se utilizan los datos de la secuenciación genómica para describir la biodiversidad, supervisar los cambios en los ecosistemas y modelar las predicciones sobre cómo responderán los organismos a nivel genético a los cambios a nivel ambiental.

Cómo comenzar

Introducción a Amazon Genomics CLI

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