Vertex Pharmaceuticals Mengurangi Biaya Penyimpanan dan Pemrosesan Data Cryo-EM hingga 50% Menggunakan AWS

Dengan bermigrasi ke AWS, Vertex memigrasikan beban kerjanya lebih dekat ke tempat data tiba di Amazon Simple Storage Service (Amazon S3)—layanan penyimpanan objek yang menawarkan skalabilitas, ketersediaan data, keamanan, dan performa terdepan di industri. Vertex juga menggunakan Amazon FSx for Lustre, penyimpanan bersama terkelola penuh yang dibangun di salah satu sistem file beperforma tinggi paling populer di dunia, untuk memberi ilmuwan jumlah sumber daya penyimpanan yang mereka butuhkan selama analisis aktif.

Setelah diproses, Vertex mengirimkan data kembali ke Amazon S3. Perusahaan mengurutkan data secara efisien menggunakan kebijakan Siklus Hidup Amazon S3, kumpulan aturan yang menentukan tindakan yang diterapkan Amazon S3 ke grup objek. “Dengan menggunakan kebijakan Siklus Hidup Amazon S3, kami dapat memasukkan data ke berbagai tingkatan untuk menurunkan biaya penyimpanan,” kata Iturralde. Perusahaan juga dapat menskalakan penyimpanannya dengan lancar, membatasi overhead pusat data.

Untuk mengelola komputasi untuk pemrosesan data, Vertex menggunakan AWS ParallelCluster, alat manajemen klaster sumber terbuka yang membuatnya mudah untuk melakukan deployment dan mengelola klaster HPC elastis di AWS. Alat ini akan memutar simpul HPC ke atas dan ke bawah berdasarkan permintaan perangkat lunak analisis. “Setelah selesai, kami dapat kembali dengan pembayaran hampir nol,” kata Iturralde. “Kami tidak perlu mengkhawatirkan laju sains yang akan memenuhi sumber daya kami atau mengalihkan perhatian kami untuk mempertahankan infrastruktur.”

Dengan mencocokkan biaya komputasinya dengan tuntutan beban kerja, Vertex telah mengurangi biaya hingga 50 persen. Selanjutnya, Vertex telah mencapai performa dua kali lebih baik daripada arsitektur sebelumnya. Dan Vertex telah menghilangkan hambatan yang dihadapi tim cryo-EM di lingkungan on-premise saat berbagi sumber daya dengan grup lain, yang sering dilakukannya. “Sebelumnya, analisis data cryo-EM membutuhkan waktu berminggu-minggu, bahkan ketika tidak ada sumber daya yang sedang digunakan,” kata Posson. “Sekarang, kami dapat mengirimkan data dengan andal dalam waktu kurang dari 1 minggu menggunakan AWS.”

Vertex menambahkan dukungan sistem masuk tunggal native menggunakan Amazon Cognito, yang dapat digunakan bisnis untuk menambahkan kontrol daftar, masuk, dan akses ke aplikasi web dan seluler dengan cepat dan mudah. “Menggunakan Amazon Cognito memberi kami kenyamanan tambahan di mana hanya karyawan yang sesuai yang memiliki akses ke perangkat lunak,” kata Iturralde. Bersamaan dengan ini, Vertex menggunakan Penyeimbang Beban Aplikasi—yang menyeimbangkan beban lalu lintas HTTP dan HTTPS dengan perutean permintaan lanjutan yang ditargetkan pada pengiriman aplikasi modern—untuk mengamankan jaringannya.

Di AWS, Vertex telah membuat prosesnya menjadi efisien, dapat diskalakan, dan hemat biaya sekaligus mengurangi pemeliharaan manual. Membangun di AWS juga berarti bahwa perusahaan memiliki akses ke sumber daya komputasi dan GPU terbaru tanpa waktu tunggu selama berbulan-bulan terkait dengan pengadaan perangkat keras pusat data. Misalnya, Vertex menjalankaninstans Amazon EC2 G5, yang memberikan kombinasi kuat antara CPU, memori host, dan kapasitas GPU. Dengan melakukan proses cryo-EM di cloud, para ilmuwan dapat melakukan analisis hampir secara waktu nyata. Vertex menggunakan waktu mikroskop mahal lebih efisien dan memfasilitasi terobosan ilmiah.