Amazon Genomics CLI

在雲端輕鬆高效地處理 PB 級原始基因體和生物資料。

只需幾條命令列,即可在幾分鐘內在 AWS 上設定工作流程引擎,例如 Cromwell 和 Nextflow,而無需變更現有程式碼或修改開放原始碼基因體工具。

自動執行耗時的任務,例如設定和部署工作流程引擎、建立資料存取政策以及調校運算叢集以實現大規模營運。

在更短的時間內以更高的規模執行基因體工作流程,從而減少獲得有用洞察 (如變異識別和疾病診斷) 的時間。

運作方式

Amazon Genomics CLI 是面向基因體和生命科學客戶的開放原始碼工具,可簡化和自動化雲端基礎設施的部署,為您提供易於使用的命令列介面,以便在由 WDL 等語言指定的 Amazon Web Services (AWS) 上快速設定和執行基因體工作流程。透過消除在雲端中設定和執行基因體工作流程的繁重工作,軟體開發人員和研究人員可以自動佈建、設定和擴展雲端資源,以實現更快、更具成本效益的群體層面遺傳學研究、藥物發現週期等。
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使用案例

精準醫學

啟用基因體定序資料分析並將結果應用於臨床環境以改善人類健康。在群體層面,確定在病原體爆發期間容易出現特定健康問題的群體或攜帶者。

藥物發現和開發

利用人類遺傳學和基因功能知識來開發預防性治療方式和新藥發現。

環境基因體

使用基因體定序資料來描述生物多樣性特徵,監測生態系統變更,並模擬生物體如何在基因水平上對環境水平變化作出回應的預測。

如何開始使用

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造訪 GitHub 以下載和安裝說明。

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