Nível gratuito

Como parte do nível gratuito da AWS, você pode começar a usar gratuitamente o Amazon Omics. O nível gratuito começa no primeiro mês quando você cria o primeiro recurso no Amazon Omics. Os detalhes do nível gratuito do Amazon Omics estão na tabela abaixo.

 

Uso do nível gratuito por mês nos primeiros dois meses

Armazenamento do Amazon Omics 1500 gigabases-meses na classe de armazenamento ativo e 1500 gigabases-meses na classe de armazenamento de arquivamento
Fluxos de trabalho do Amazon Omics

275 horas de instância omics.m.xlarge ou instâncias de computação equivalentes e 49.000 GB-horas de armazenamento de execuções

Análise do Amazon Omics 200 gigabyte-meses

Preços de armazenamento do Amazon Omics

Quando armazena sequências genômicas no armazenamento do Amazon Omics, você paga pelo armazenamento por gigabase por mês. Um gigabase é um bilhão de bases de arquivos de sequências importados (como FASTQ, BAM e CRAM). O armazenamento do Amazon Omics armazena as bases, os índices de qualidade, os alinhamentos e outros metadados dos arquivos de origem. Você paga por gigabase armazenado, para que não precise se preocupar com formatos de arquivo ideais ou técnicas de compactação. O Amazon Omics cuida de tudo isso para você.

Os objetos de sequência são chamados de conjuntos de leitura e são logicamente equivalentes a um arquivo FASTQ, BAM ou CER. O armazenamento do Amazon Omics oferece uma classe de armazenamento ativo e uma classe de armazenamento de arquivamento para conjuntos de leitura. Armazenar conjuntos de leitura na classe de arquivamento custa menos por mês do que armazená-los na classe ativa. Os conjuntos de leitura na classe ativa podem ser acessados em milissegundos, enquanto os conjuntos de leitura na camada de arquivamento precisam ser ativados antes que possam ser acessados. Após não terem sido acessados por 30 dias, conjuntos de leitura são movidos automaticamente para a classe de armazenamento de arquivamento de baixo custo até que sejam reativados.

Não é cobrada nenhuma taxa de importação para conjuntos de leitura. O armazenamento do Amazon Omics é cobrados por um período mínimo de armazenamento de 30 dias, e os objetos excluídos antes de 30 dias incorrem em uma cobrança pro rata equivalente à cobrança pelo armazenamento dos dias restantes. O armazenamento do Amazon Omics foi criado para dados de longa duração que são acessados raramente e retidos durante anos.

Você paga por solicitações GET feitas aos objetos de conjunto de leitura. Todos os outros tipos de solicitação em conjuntos de leitura são gratuitos.

Preços de análise do Amazon Omics

A análise do Amazon Omics ajuda você a preparar dados de variáveis genômicas e anotações genômicas para uso com o amplo conjunto de serviços de análise e machine learning da AWS, como o Amazon Athena e o Amazon SageMaker. Você pode armazenar qualquer quantidade de dados de variáveis genônicas e só pagará pelo que usar. O tamanhos dos dados é definido como o tamanho dos dados transformados. Porém, quando consulta e analisa os dados em outros serviços, você paga pelo uso desses serviços.

A análise do Amazon Omics é cobrada por um período mínimo de armazenamento de 30 dias e os dados excluídos antes de 30 dias incorrem em uma cobrança pro rata equivalente à cobrança pelo armazenamento pelos dias restantes.

Preços de fluxos de trabalho do Amazon Omics

O Amazon Omics também gerencia a interpretação e a execução de fluxos de trabalho de bioinformática. Os fluxos de trabalho do Amazon Omics podem executar roteiros de bioinformática escritos nas duas linguagens de fluxo de trabalho mais usadas, WDL e Nextflow. Uma única execução desses roteiros é chamada de rodada. Você paga apenas pelo que usa e é cobrado separadamente pelos tipos de instância do Omics e pelo armazenamento de execuções. Todas as tarefas do fluxo de trabalho são mapeadas para a instância que melhor se ajuste aos recursos definidos. Por exemplo, uma tarefa definida para usar 8 CPUs e 60 GB de RAM será mapeada para o tipo de instância omics.r.2xlarge para execução. Os logs de fluxo de trabalho são armazenados nos logs do Amazon CloudWatch em sua conta e cobrados no CloudWatch pelo tempo que você decidir retê-los. Você pode configurar o serviço para que informe o uso de recursos por execução para simplificar o orçamento, o planejamento e a contabilidade.

Exemplos de preço

Exemplo 1

Uma iniciativa de sequenciamento populacional está começando a sequenciar indivíduos de um biobanco que eles coletaram. Eles decidem fazer isso na região Oeste da UE (Irlanda). Eles sequenciam 100.000 indivíduos, 130 gigabases cada, e armazenam os dados brutos de sequenciamento no armazenamento do Amazon Omics. Durante os próximos cinco anos, eles permanecem na classe de armazenamento de arquivamento após os 30 dias seguintes à importação e são acessados duas vezes, em média, quando passam para a classe de armazenamento ativo por 30 dias. Cada genoma é baixado em 500 partes, gerando 500 chamadas de API GET. O custo total ao longo de cinco anos para um único genoma é:
Classe de armazenamento ativo: USD 0,005769 por gigabase/mês * 130 gigabases * 90 dias = USD 2,22
Classe de armazenamento de arquivamento: USD 0,001154 por gigabase/mês * 130 gigabases * (1825 – 90) dias = USD 8,56.
APIs GET: USD 0,005 / 1000 chamadas de API * (2 * 500 chamadas de API) = USD 0,005
Custo total em 5 anos: USD 2,22 + USD 8,56 + USD 0,005 = USD 10,79 (ou USD 2,16/ano)

Exemplo 2

Uma cientista de bioinformática deseja executar um fluxo de trabalho Nextflow em fluxos de trabalho do Amazon Omics na região Leste dos EUA (Norte da Virgínia). Ela tem três tarefas no fluxo de trabalho. A primeira reserva 16 vCPUs e 30 GB de memória e leva 3 horas para ser executada. A segunda reserva 32 vCPUs e 160 GB de memória e leva 2 horas para ser executada. A terceira reserva 4 vCPUs e 10 GB de memória e leva 10 minutos para ser executada. A cliente registra o fluxo de trabalho e chama a API StartRun com o sistema de arquivos padrão de 1200 GB. Seus custos gerais são:
Tarefa1 (omics.c.4xlarge): 0,9180/h * 3 h = 2,754 USD
Task 2 (omics.r.8xlarge):
2,7216 USD/h * 2 h = 5,4432 USD
Tarefa 3 (omics.m.xlarge): 0,2592 USD/h * 1/6 h = 0,0432 USD
Armazenamento: 0,0001918 USD/ GB-hora * (1200 GB*(3 h+2 h+1/6 h)) = 1,18916 USD
Total: 9,42956 USD

Exemplo 3

Um cientista de dados tem 3.202 arquivos no formato de chamada de variável (VCF) que ele deseja analisar no Amazon Athena na região Leste dos EUA (Norte da Virgínia). Ele cria um repositório de variáveis e ingere esses arquivos usando as APIs do Amazon Omics. Os dados ingeridos têm 1,5 TB de tamanho. Ao longo do mês seguinte, ele executa 1.000 consultas no Athena, calculando frequências alélicas para diferentes subpopulações, cada uma consumindo em média 50 GB. Seus custos mensais gerais são:
Armazenamento variável: USD 0,035 por GB/mês * (1024 GB/TB * 1,5 TB) = USD 53,76
Amazon Athena: USD 5/TB * 1000 * 50 / 1024 = USD 244,14

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