ميزات AWS HealthOmics

تعمل AWS HealthOmics على تسهيل تخزين البيانات الجينومية والنسخية وغيرها من بيانات omics والاستعلام عنها وتحليلها ثم إنشاء رؤى من تلك البيانات. تعمل على تبسيط وتسريع عملية تخزين وتحليل المعلومات المتعددة للبحث والتطبيقات السريرية، حتى تتمكن من التركيز على استخلاص رؤى أعمق من بياناتك.

باستخدام وحدة تخزين AWS HealthOmics، يمكنك تخزين بيتابايت من بيانات omics بكفاءة وفعالية من حيث التكلفة، مما يسمح بالاكتشاف العلمي على نطاق السكان. تعمل عمليات سير عمل AWS HealthOmics الخاصة وReady2Run على أتمتة توفير البنية التحتية للحوسبة وتوسيع نطاقها، بحيث يمكنك تشغيل خطوط أنابيب تحليل المعلوماتية الحيوية على نطاق الإنتاج وقضاء وقت أقل في إدارة البنية التحتية والمزيد من الوقت في إجراء البحوث. يأتي AWS HealthOmics مع مجموعة من عمليات سير عمل Ready2Run التي تم إنشاؤها مسبقًا وتسعيرها لكل تشغيل. تعمل تحليلات AWS HealthOmics على تبسيط إعداد بيانات omics للتحليلات متعددة الوسائط، مما يتيح لك جمع بيانات البيانات المتعددة والسجلات الصحية معًا وإنشاء علاج أكثر استهدافًا وتخصيصًا. هذه الميزات مؤهلة أيضًا لـ HIPAA.

يتوافق تخزين AWS HealthOmics مع تنسيقات ملفات المعلوماتية الحيوية مثل FASTQ وBAM وCRAM ويسمح لك بتخزين هذه البيانات واكتشافها ومشاركتها بكفاءة وبتكلفة منخفضة. يتم تخزين تنسيقات الملفات هذه ككائنات معدة للقراءة داخل مخزن متسلسل. يمكنك أيضًا تخزين الجينومات المرجعية بتنسيق FASTA. يتم استيراد البيانات ككيانات غير قابلة للتغيير مع معرفات فريدة لدعم أعباء العمل التي تتطلب مصدر بيانات صارم. يمكن التحكم في الوصول إلى كائنات البيانات الفردية، بما في ذلك المراجع وكائنات مجموعة القراءة، باستخدام العلامات وضوابط الوصول القائمة على السمات من خلال إدارة الهوية والوصول في AWS (IAM). لتقليل تكاليف التخزين طويلة الأجل، يتم نقل كائنات البيانات التي لم يتم الوصول إليها في غضون 30 يومًا تلقائيًا إلى فئة تخزين الأرشيف. يمكن إعادة تنشيط الكائنات المؤرشفة في أي وقت باستخدام استدعاء واجهة برمجة التطبيقات.

تساعدك AWS HealthOmics على تشغيل عمليات سير عمل المعلوماتية الحيوية على نطاق واسع. يمكنك اختيار مهام سير عمل Ready2Run أو إحضار مهام سير العمل الخاصة بك لمعالجة بياناتك البيولوجية بدون الحاجة إلى إدارة البنية التحتية الأساسية.

مهام سير عمل Ready2Run هي مهام سير عمل مُعدة مسبقًا من قِبل شركات برمجيات تابعة لجهات خارجية رائدة في المجال، مثل Sentieon, Inc. وNVIDIA وElement Biosciences جنبًا إلى جنب مع المسارات مفتوحة المصدر الشائعة، مثل سير عمل GATK لأفضل الممارسات من Broad Institute وAlphaFold للتنبؤ ببنية البروتين. يمكنك ببساطة استخدام مهام سير عمل Ready2Run لمعالجة بياناتك بدون الحاجة إلى إدارة أدوات البرمجيات أو برامج سير العمل النصية. تُحسب تكلفة مهام سير عمل Ready2Run حسب نظام الدفع مقابل كل تشغيل بسعر محدد مسبقًا.

تتيح لك مهام سير العمل الخاصة إمكانية إحضار برامج سير العمل النصية الخاصة بك والمكتوبة بلغة وصف سير العمل (WDL) أو Nextflow، وهما لغتا سير العمل الأكثر استخدامًا. يمكنك تشغيل عمليات سير العمل الخاصة هذه عن طريق عملية تنفيذ واحدة تُعرف باسم "التشغيل". بالنسبة لمهام سير العمل الخاصة، لا تدفع إلا نظير ما تطلبه، ويجرى إصدار فواتير منفصلة لك عن أنواع مثيلات omics وسعة تخزين التشغيل. يُعين لجميع المهام الموجودة في سير العمل أفضل مثيل ملائم لمواردك المحددة.

باستخدام AWS HealthOmics، يمكنك استيعاب تنسيقات بيانات الجينوم وتحويلها بسرعة مثل (g) VCF وGFF3 وTSV/CSV إلى جداول Apache Iceberg. يمكنك جعل بيانات علم الجينوم سهلة الوصول من خلال خدمات التحليلات، مثل Amazon Athena. يمكنك تحويل كل من البيانات المتغيرة (بيانات من عينة فردية) وبيانات التعليقات التوضيحية (معلومات معروفة حول المواضع في الجينوم). يمكنك التحكم في الوصول إلى متاجر التحليلات باستخدام AWS Lake Formation، مما يسهل إجراء الاستفسارات عبر مصادر البيانات المتنوعة أثناء تنفيذ ضوابط الوصول الدقيقة. على سبيل المثال، يمكنك دمج بيانات علم الجينوم للأفراد بشكل آمن مع تاريخهم الطبي من Amazon HealthLake - والتي يمكن أن تشمل العلاجات السابقة أو الأدوية أو التقارير المعملية - لتسهيل الطب الدقيق.

تسهل AWS HealthOmics على الباحثين وضع علامات على المتعاونين وإعداد أذوناتهم ومشاركة البيانات بأمان معهم. هذا يبسط كيفية جعل بيانات omics الخاصة بك قابلة للعثور عليها، ويمكن الوصول إليها، وقابلة للتشغيل المتبادل، وقابلة لإعادة الاستخدام (FAIR). باستخدام البيانات الوصفية الخاصة بالمجال، يمكنك ربط مخازن بيانات AWS HealthOmics ببيانات omics وبيانات الرعاية الصحية الأخرى لتسهيل التحليلات متعددة الوسائط ومتعددة الوسائط.

برنامج AWS HealthOmics مؤهل لبرنامج HIPAA. يمكنك تطبيق ضوابط قائمة على السمات لتحديد الوصول إلى البيانات الدقيقة والإدارة. التسجيل الشامل وتسجيل المصدر حتى تعرف البيانات التي تم الوصول إليها ومن وصل إليها ومتى تم ذلك.