Ускорение геномных исследований

С помощью AWS клиенты из сферы геномики могут выделять больше времени и ресурсов на науку, ускоряя получение ценных данных и революционных результатов, выводя на рынок продукты для спасения жизней.

AWS позволяет клиентам внедрять инновации, делая геномные данные более доступными и полезными. AWS предоставляет множество сервисов для сокращения времени между секвенированием и интерпретацией результатов, обеспечивая безопасное и эффективное сотрудничество при работе с наборами многомодальных данных. Кроме того, вы можете выбрать подходящий и в то же время экономный инструмент для работы в глобальных масштабах, который ускорит проведение современных геномных исследований.

Accelerate Genomic Discoveries on AWS (1:06)

100 Гбит/с

пропускная способность сети

В 2 раза

больше регионов с множеством зон доступности, чем у ближайшего конкурента в сфере облачных решений

24

региона для поддержки независимости данных

90 %

потенциальной экономии по сравнению с оплатой по требованию

В 100 раз

более быстрая работа инстансов Amazon EC2 F1 по сравнению с CPU

Более 200

полнофункциональных сервисов от центров обработки данных во всем мире

Преимущества

Сокращение времени открытий

Эффективные вычислительные мощности и возможности машинного обучения обеспечивают быстрый и контролируемый запуск рабочих нагрузок. AWS предоставляет широчайший набор вычислительных сервисов среди всех поставщиков облачных технологий, и только AWS предлагает вычислительные инстансы с пропускной способностью сети 100 Гбит/с.

Высокая производительность при низких затратах

Гибкие цены и модель выделения вычислительных ресурсов по требованию позволяют исследователям справляться со сложными проектами по геномике без необходимости в оплате простаивающей инфраструктуры или выделении большего числа ядер при пиковых нагрузках. AWS дает возможность оплаты по факту использования и практически неограниченные вычислительные мощности.

Безопасное сотрудничество в глобальных масштабах

Глобальное распределение регионов и охват сети AWS отвечают глобальной сути науки и обеспечивают безопасность и контроль доступа позволяют исследователям управлять совместным использованием данных. AWS – это наиболее безопасная, расширяемая и надежная глобальная облачная инфраструктура. В рамках программы открытых данных AWS доступно более 40 открытых наборов данных в области медико-биологических разработок и геномики, которые позволяют обеспечить эффективное сотрудничество, предоставляя научному и клиническому сообществу единый задокументированный источник достоверной информации.

Партнеры AWS в сфере геномики

AWS предлагает крупнейшую партнерскую сеть, гибкий выбор рабочих процессов, а также варианты полностью управляемых решений, которые ускорят для вас получение результатом геномных исследований.

Узнать больше о партнерах AWS по геномике »

Примеры использования

  • Передача и хранение данных
  • Автоматизация рабочего процесса
  • Сбор данных
  • Третичный анализ
  • Клинические приложения
  • Открытые пакеты данных
  • Оптимизация затрат
  • Передача и хранение данных
  • Передача и хранение данных

    Объем данных в области геномики представляет собой проблему: сложно обеспечить их быструю и контролируемую передачу из секвенсеров, а затем найти ресурсы хранилища, которые могут вместить весь объем и обеспечить производительность по доступной цене. AWS позволяет исследователям управлять крупными объемами данных, которые превосходят масштабы локальной инфраструктуры. Передавая данные в облако AWS, организации могут воспользоваться преимуществом высокой пропускной способности для приема данных, экономически эффективными вариантами хранилища, безопасного доступа и эффективного поиска для ускорения геномных исследований. 

    Посмотреть связанные решения »

    diagram_data-transfer-storage_1

    Отзывы клиентов

    Блог: Using Amazon FSx for Lustre for Genomics Workflows on AWS

    Читать блог »

    Блог: Genomic data compression storage and access

    Читать блог »

    Building Life Sciences and Genomics Data Workflows with AWS Storage Gateway (24:16)

    Cмотреть видео »
  • Автоматизация рабочего процесса
  • Автоматизация рабочего процесса для вторичного анализа

    Организации, которые занимаются геномными исследованиями, могут встречать трудности при отслеживании источников данных во время вторичного анализа и при выполнении воспроизводимых и масштабируемых рабочих нагрузок при снижении нагрузки на ИТ-кадры. AWS предлагает сервисы для масштабируемого и экономного анализа данных и упрощенного управления для запуска и автоматизации параллельных рабочих нагрузок. Для автоматизации рабочих процессов предусмотрен воспроизводимый поиск или клинические приложения, а оптимизированные для AWS партнерские (NVIDIA и DRAGEN) решения и решения с открытым исходным кодом (Cromwell и Nextflow) помогают оркестраторам рабочих процессов масштабировать анализ данных. 

    Посмотреть связанные решения »

    diagram_workflow-automation_1

    Отзывы клиентов

    Решение для вторичного геномного анализа

    Подробнее »

    Nextflow на AWS – краткое руководство

    Читать руководство »

    Использование Cromwell с AWS Batch

    Читать блог »
  • Сбор данных
  • Сбор данных и управление ими

    Успешность геномного использования и его интерпретация часто зависят от множества разнородных наборов данных с разными модальностями о крупных популяциях. AWS позволяет организациям упорядочивать мультиомические наборы данных и обеспечивать надежный доступ к данным и управление разрешениями для глобальной инфраструктуры, чтобы поддерживать целостность данных, когда в исследовании задействовано много участников и заинтересованных лиц. AWS упрощает процессы хранения, опроса и анализа геномных данных и их связывания с клинической информацией. 

    Посмотреть связанные решения »

    diagram_data-aggregation_1

    Отзывы клиентов

    Решение для третичного геномного анализа с использованием озер данных

    Подробнее »

    Hail on AWS – краткое руководство

    Читать руководство »
  • Третичный анализ
  • Интерпретация и глубокое обучение для третичного анализа

    Для анализа нужны интегрированные наборы данных и базы знаний с разными модальностями, высокая эффективность вычислений, анализ больших данных и машинное обучение в масштабе предприятия. Ранее на это уходили недели и даже месяцы, что замедляло процесс получения аналитической информации. AWS ускоряет анализ больших данных с помощью машинного обучения и высокопроизводительных вычислений. Благодаря AWS исследователи получают доступ к высокопроизводительным вычислениям в крупных масштабах, воспроизводимым процессам обработки данных, возможностям интеграции данных для использования многомодальных наборов данных, а также общедоступным данным для клинических аннотаций, и все это – в среде, в которой предусмотрено соблюдение нормативных требований. 

    Посмотреть связанные решения »

    diagram_interpretation-deep-learning_1

    Отзывы клиентов

    Решение для третичного геномного анализа с использованием озер данных

    Подробнее »

    Решение для третичного геномного анализа и машинного обучения

    Подробнее »

    Блог: Building scalable image processing pipeline for image-based transcriptomics

    Читать блог »
  • Клинические приложения
  • Клинические приложения

    Существует несколько препятствий на пути к развитию и принятию геномики для клинических приложений. Это, среди прочих, скорость проведения анализа, управление защищенной информацией о здоровье (PHI) и предоставление воспроизводимых и поддающихся интерпретации результатов. Пользуясь преимуществами облака AWS, организации могут развивать свои навыки в области геномики, чтобы продвигать приложения в сфере точной медицины и ухода за пациентами. Сервисы AWS позволяют использовать геномику в работе клиники, предоставляя технологии захвата данных, вычислений и хранения данных, которые дают возможность модернизированной клинической лаборатории сократить время получения результатов при соблюдении самых строгих правил относительно конфиденциальности. 

    Посмотреть связанные решения »

    diagram_clinical-genomics_1

    Отзывы клиентов

    Обработка и защита клинических геномных данных

    Посмотреть видео »

    Улучшение результатов с помощью вычислительной геномики

    Подробнее »

    Геномная диагностика и обнаружение в любых масштабах

    Подробнее »
  • Открытые пакеты данных
  • Открытые пакеты данных

    По мере того как все большее количество научно-исследовательских организаций переходят в облако и оптимизируют свои процессы для облака, они приносят с собой эталонные наборы данных, часто в персональных корзинах, что приводит к созданию дубликатов, способствует разрозненности и недостаточному документированию версий для часто используемых наборов данных. Программа открытых данных (ODP) AWS помогает упростить доступ к данным, делая их доступными в Amazon S3 и предоставляя исследовательскому сообществу единый задокументированный источник достоверной информации. Это повышает воспроизводимость исследований, способствует сотрудничеству в сообществе и сокращает масштабы дублирования данных. Кроме того, ODP покрывает расходы на хранилище Amazon S3, исходящий трафик и передачу наборов данных между регионами.

    diagram_open-data_1

    Отзывы клиентов

    Просмотреть все доступные открытые наборы данных по геномике

    Просмотреть набор данных »

    Огромный объем данных по геномике на AWS для институтов

    Читать блог »

    Инициатива STRIDES национальных институтов здравоохранения при поддержке AWS

    Читать блог »
  • Оптимизация затрат
  • Оптимизация затрат

    Исследователи используют крупные наборы данных с геномной информацией, для которых требуются большие хранилища и мощные вычислительные ресурсы, что может оказаться дорогостоящим решением. AWS предоставляет исследователям в области геномики экономные варианты для всего жизненного цикла данных: от хранения до интерпретации. Инфраструктура и сервисы данных AWS позволяют организациям экономить время, деньги и выделять больше ресурсов на науку.

    diagram_cost-optimization_1

    Отзывы клиентов

    Публикация в блоге. Спасение коал с помощью геномных исследований и облачных вычислений

    Читать блог »

    Спотовые инстансы Amazon EC2

    Подробнее »

    Классы хранилищ Amazon S3

    Читать блог »

Обеспечение соответствия в сфере геномики

Благодаря AWS исследователи получают доступ к высокопроизводительным вычислениям в крупных масштабах, воспроизводимым процессам обработки данных, возможностям интеграции данных для использования многомодальных наборов данных, а также общедоступным данным для клинических аннотаций, и все это – в среде, в которой предусмотрено соблюдение нормативных требований.

Узнать больше об обеспечении соответствия в области геномики с помощью AWS »

Примеры использования и ресурсы

Просмотреть все примеры использования и сопутствующие ресурсы от клиентов, занимающихся геномикой.

Пример использования: Illumina

Пример использования: Illumina

Illumina разрабатывает, производит и продает интегрированные системы для геномного анализа. Эта компания перешла к использованию спотовых инстансах Amazon EC2 и Amazon S3, что позволило ей сократить ежемесячные затраты на вычисления приблизительно на 300 000 USD, а на хранилище – примерно на 90 000 USD.

Ознакомиться с примером использования »

Пример использования в программе Фреда Хатча

Пример внедрения в рамках программы Фреда Хатча по исследованию микробиома

Программа Фреда Хатча посвящена повышению эффективности лекарств для лечения от рака, и в ходе ее реализации гигабайты геномных данных преобразуются в аналитические данные. С помощью Nextflow исследователи управляют процессами AWS Batch и исследуют их с помощью спотовых инстансов Amazon EC2, что позволяет экономить средства и уделять больше времени анализу.

Ознакомиться с примером использования »

DNAnexus

Пример использования: DNAnexus

Компания DNANexus разработала платформу для облачной геномной информатики и управления данными на AWS. Благодаря AWS компания DNAnexus обеспечила соответствие нормативным требованиям и безопасность, а также точную регулировку данных для прозрачности, воспроизводимости и предоставления.

Ознакомиться с примером использования »

Пример использования: Fabric Genomics

Пример использования: Fabric Genomics

Fabric Genomics предоставляет решения для сквозного анализа геномных данных, их аннотирования, курирования, классификации и создания отчетности для клинического использования. Компания Fabric Genomics выбрала AWS для размещения своего ПО, благодаря быстроте вычислений и безопасности.

Ознакомиться с примером использования »

Пример использования: Seven Bridges

Пример использования: Seven Bridges Genomics

Компания Seven Bridges Genomics создала свою платформу геномного анализа на AWS, сделав анализ более доступным и финансово выгодным для исследователей. 

Ознакомиться с примером использования »

Пример использования Baylor Medicine

Пример использования: Медицинский колледж Бэйлора

Медицинский колледж Бейлора работает над идентификацией генов, которые отвечают за старение и сердечные болезни. Колледж Baylor совместно с компанией DNAnexus создали решение, построенное исключительно на основе AWS, платформу DNAnexus как услугу, использующую Amazon S3 и Amazon Glacier для хранения более 1 петабайта геномных данных колледжа.

Ознакомиться с примером использования »

Пример использования Bayer CropScience

Пример использования Bayer CropScience

Компания Bayer CropScience помогает клиентам определять, где и когда садить растения, для чего требуется циклически использовать рабочие нагрузки. Компания Bayer обратилась к AWS, чтобы получить более гибкое и экономное решение для своей платформы.

Ознакомиться с примером использования »

Пример использования: школа медицины Икана

Пример использования: школа медицины Икана медицинского центра Маунт‑Синай

Школа медицины Икана при медицинском центре Маунт-Синай и компания Station X создали программную платформу геномных данных GenePool. Благодаря тому, что платформа основана на AWS, она может масштабироваться за считанные минуты и хранить данные для преобразования и клинической геномики.

Ознакомиться с примером использования »

Начало работы с AWS

Начать работу

Лидирующие компании в области геномики уже используют решения AWS. Свяжитесь с нашими специалистами и начните работать с облаком AWS уже сегодня.
Подпишитесь на информационную рассылку AWS по геномике
Получайте свежие новости AWS по геномике прямо в папке входящих сообщений.
Подписаться »