Acelere as descobertas genômicas

Com a AWS, os clientes da genômica podem dedicar mais tempo e recursos à ciência, acelerando o tempo para insights, alcançando pesquisas inovadoras com mais rapidez e trazendo produtos que salvam vidas ao mercado.

A AWS permite que os clientes inovem tornando os dados genômicos mais acessíveis e úteis. A AWS oferece a amplitude e a profundidade dos serviços para reduzir o tempo entre o sequenciamento e a interpretação, com recursos de colaboração seguros e sem atrito em conjuntos de dados multimodais. Além disso, você pode escolher a ferramenta certa para o trabalho, a fim de obter o melhor custo e desempenho em escala global, acelerando o estudo moderno da genômica.

Accelerate Genomic Discoveries on AWS (1:06)

100 Gbps

da taxa de transferência da rede

2x

mais regiões com múltiplas Zonas de Disponibilidade do que o próximo maior provedor de nuvem

24

Regiões lançadas, para dar suporte a soberania dos dados

90%

de economia potencial em comparação com os preços sob demanda

100x

aceleração com instâncias Amazon EC2 F1 em comparação com CPUs

Mais de 200

serviços em destaque de datacenters em todo o mundo

Benefícios

Acelere o tempo de descoberta

Opções poderosas de computação e machine learning garantem que os cientistas possam executar cargas de trabalho com rapidez e controle. A AWS oferece a mais ampla seleção de serviços de computação, mais do que qualquer outro provedor de nuvem. Apenas a AWS oferece instâncias de computação que fornecem 100 Gbps de taxa de transferência de rede.

Mantenha os custos baixos e o desempenho alto

A definição de preço flexível e a natureza sob demanda da computação em nuvem permitem que os pesquisadores lidem com projetos genômicos complexos, sem ter que pagar por infraestrutura ociosa ou se esforçar para aumentar os núcleos durante cargas de trabalho intensas. A AWS oferece definição de preço pré-pago e capacidade de computação virtualmente ilimitada.

Colaboração segura em escala global

A área de cobertura global das regiões da AWS e da rede corresponde à natureza global da ciência, com segurança e controles de acesso que permitem aos pesquisadores de genômica gerenciar o compartilhamento de dados. A AWS é a infraestrutura de nuvem global mais segura, extensa e confiável. O programa de dados abertos da AWS está disponível publicamente, com mais de 40 conjuntos de dados abertos de ciências biológicas e genômica para permitir uma colaboração sem atrito, fornecendo às comunidades clínicas e de pesquisa uma única fonte documentada da verdade.

Parceiros da AWS de genômica

A AWS oferece a maior rede de parceiros, junto com escolha flexível de fluxo de trabalho e opções para soluções totalmente gerenciadas para ajudá-lo a obter insights genômicos mais rapidamente.

Saiba mais sobre os Parceiros da AWS de genômica »

Casos de uso

  • Transferência e armazenamento de dados
  • Automação do fluxo de trabalho
  • Agregação de dados
  • Análise terciária
  • Aplicações clínicas
  • Conjuntos de dados abertos
  • Otimização de custos
  • Transferência e armazenamento de dados
  • Transferência e armazenamento de dados

    O volume de dados de genômica apresenta desafios para transferi-los de sequenciadores de maneira rápida e controlada e encontrar recursos de armazenamento que possam acomodar a escala e a performance a um custo não proibitivo. A AWS permite que pesquisadores gerenciem dados em grande escala que ultrapassaram a capacidade da infraestrutura on-premises. Ao transferir dados para a Nuvem AWS, as organizações podem aproveitar as vantagens da ingestão de dados de alta taxa de transferência, opções econômicas de armazenamento, acesso seguro e pesquisa eficiente para impulsionar a pesquisa de genômica. 

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    Referências de clientes

    Blog: Using Amazon FSx for Lustre for Genomics Workflows on AWS

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    Blog: Genomic data compression storage and access

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    Vídeo: Building genomics data workflows with AWS Storage Gateway

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  • Automação do fluxo de trabalho
  • Automação de fluxo de trabalho para análise secundária

    As organizações de genômica podem ter dificuldade em rastrear as origens dos dados ao realizar análises secundárias e executar fluxos de trabalho reproduzíveis e escalonáveis, minimizando a sobrecarga de TI. A AWS oferece serviços para análise de dados econômica e escalonável e orquestração simplificada para executar e automatizar fluxos de trabalho paralelizáveis. As opções para automatizar os fluxos de trabalho permitem pesquisas reproduzíveis ou aplicações clínicas, enquanto as soluções nativas, parceiras (NVIDIA e DRAGEN) e de código aberto da AWS (Cromwell e Nextflow) fornecem opções flexíveis para orquestradores de fluxo de trabalho para ajudar na análise de dados de escala. 

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    Referências de clientes

    Solução de análise secundária de genômica

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    Nextflow no AWS Quick Start

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    Usando o Cromwell com o AWS Batch

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    Illumina DRAGEN na AWS

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  • Agregação de dados
  • Agregação de dados e governança

    Pesquisas e interpretações genômicas bem-sucedidas geralmente dependem de conjuntos de dados múltiplos, diversos e multimodais de grandes populações. A AWS permite que as organizações harmonizem conjuntos de dados multi-omic e governem controles robustos de acesso a dados e permissões em uma infraestrutura global para manter a integridade dos dados, já que a pesquisa envolve mais colaboradores e partes interessadas. A AWS simplifica a capacidade de armazenar, consultar e analisar dados de genômica e vinculá-los a informações clínicas. 

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    Referências de clientes

    Análise terciária de genômica e solução de data lakes

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    Hail on AWS Quick Start

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  • Análise terciária
  • Interpretação e aprendizado profundo para análise terciária

    A análise requer conjuntos de dados multimodais integrados e bases de conhecimento, potencial computacional intensivo, análise de big data e machine learning em escala, o que, historicamente, pode levar semanas ou meses, atrasando o tempo para os insights. A AWS acelera a análise de grandes dados de genômica, utilizando o machine learning e a computação de alta performance. Com a AWS, os pesquisadores têm acesso a uma maior eficiência de computação em escala, processamento de dados reproduzível, recursos de integração de dados para extrair conjuntos de dados multimodais e dados públicos para anotações clínicas, tudo isso em um ambiente pronto para conformidade. 

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    Referências de clientes

    Análise terciária de genômica e solução de data lakes

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    Análise terciária de genômica e solução de machine learning

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    Blog: Building scalable image processing pipeline for image-based transcriptomics

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  • Aplicações clínicas
  • Aplicações clínicas

    Existem vários obstáculos que impedem a escala e a adoção da genômica para aplicações clínicas, incluindo velocidade de análise, gerenciamento de informações protegidas de saúde (PHI) e fornecimento de resultados reproduzíveis e interpretáveis. Aproveitando os recursos da Nuvem AWS, as organizações podem estabelecer uma capacidade diferenciada em genômica para avançar com seus aplicativos na medicina de precisão e prática do paciente. Os serviços da AWS permitem o uso de genômica na clínica, fornecendo os recursos de captura, computação e armazenamento de dados necessários para capacitar o laboratório clínico modernizado a diminuir o tempo de obtenção dos resultados, ao mesmo tempo que adere aos mais rigorosos regulamentos de privacidade do paciente. 

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    Referências de clientes

    Processamento e proteção de dados genômicos clínicos

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    Melhorando os resultados com genômica computacional

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    Diagnóstico genômico e descoberta em escala

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  • Conjuntos de dados abertos
  • Conjuntos de dados abertos

    À medida que mais pesquisadores de ciências biológicas migram para a nuvem e desenvolvem fluxos de trabalho nativos da nuvem, trazem conjuntos de dados de referência com eles, geralmente em seus próprios buckets pessoais, levando à duplicação, silos e documentação de versão deficiente de conjuntos de dados comumente usados. O AWS Open Data Program (ODP) ajuda a democratizar o acesso aos dados, tornando-os prontamente disponíveis no Amazon S3, fornecendo à comunidade de pesquisa uma única fonte documentada da verdade. Isso aumenta a reprodutibilidade do estudo, estimula a colaboração da comunidade e reduz a duplicação de dados. O ODP também cobre o custo de armazenamento, saída e transferência entre regiões do Amazon S3 para conjuntos de dados aceitos.

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    Referências de clientes

    Explore todos os conjuntos de dados abertos genômicos disponíveis

    Explorar o conjunto de dados »

    Dados gnomAD do Broad Institute na AWS

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    Iniciativa NIH STRIDES com apoio da AWS

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  • Otimização de custos
  • Otimização de custos

    Os pesquisadores usam conjuntos de dados genômicos massivos que exijam opções de armazenamento em grande escala e processamento computacional poderoso, que pode ter um custo proibitivo. A AWS apresenta oportunidades de economia de custos para pesquisadores de genômica em todo o ciclo de vida dos dados, do armazenamento à interpretação. A infraestrutura e os serviços de dados da AWS permitem que as organizações economizem tempo, dinheiro e dediquem mais recursos à ciência.

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    Referências de clientes

    Blog: Salvando os Koalas usando a pesquisa genômica e a computação em nuvem

    Leia o blog »

    Instâncias spot do Amazon EC2

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    Blog: Classes de armazenamento do Amazon S3

    Leia o blog »

Conformidade em genômica

Com a AWS, os pesquisadores têm acesso a uma maior eficiência de computação em escala, processamento de dados reproduzível, recursos de integração de dados para extrair conjuntos de dados multimodais e dados públicos para anotações clínicas, tudo isso em um ambiente pronto para conformidade.

Saiba mais sobre a conformidade em genômica com a AWS »

Estudos de caso e recursos

Veja todos os estudos de caso de clientes de Genômica e recursos relacionados.

Estudo de caso da Illumina

Estudo de caso da Illumina

A Illumina desenvolve, fabrica e comercializa sistemas integrados para analisar genomas. Eles mudaram para as instâncias spot do Amazon EC2 e o Amazon S3 para economizar cerca de USD 300 mil em computação mensal e USD 90 mil em custos mensais de armazenamento.

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Estudo de caso da Fred Hutch

Estudo de caso da Iniciativa de Pesquisa da Fred Hutch Microbiome

A Fred Hutch está focada em tornar as drogas terapêuticas contra o câncer mais eficazes, por meio da tradução de gigabytes de conjuntos de dados do genoma bruto em insights. Usando o Nextflow, os pesquisadores orquestram os processos do AWS Batch e os analisam com as Instâncias spot do Amazon EC2, economizando dinheiro e fornecendo mais tempo para análise.

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DNAnexus

Estudo de caso da DNAnexus

A DNANexus desenvolveu uma plataforma de informática de genoma e gerenciamento de dados baseada em nuvem na AWS. Estar na AWS ofereceu à DNAnexus conformidade e segurança sob medida com gerenciamento de dados refinado para transparência, reprodutibilidade e proveniência de dados.

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Estudo de caso da Fabric Genomics

Estudo de caso da Fabric Genomics

A Fabric Genomics fornece soluções completas de análise, anotação, curadoria, classificação e relatórios de dados genômicos para usos clínicos. A Fabric Genomics optou por executar seu software na AWS porque oferecia alta velocidade computacional e segurança para seus clientes.

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Estudo de caso da Seven Bridges

Estudo de caso da Seven Bridges Genomics

A Seven Bridges Genomics criou sua plataforma de análise genômica na AWS, tornando a análise mais acessível e financeiramente viável para os pesquisadores. 

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Estudo de caso da Baylor Medicine

Estudo de caso da Baylor College of Medicine

A Baylor College of Medicine trabalha para identificar genes que contribuem para o envelhecimento e doenças cardíacas. A Baylor firmou parceria com a DNAnexus para uma solução criada inteiramente com a AWS, o DNAnexus PaaS, que usa o Amazon S3 e o Amazon Glacier para armazenar mais de 1 PB de dados genômicos da Baylor.

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Estudo de caso da Bayer Crop Science

Estudo de caso da Bayer Crop Science

A Bayer Crop Science ajuda seus clientes a determinar onde e quando produzir seus produtos, o que requer cargas de trabalho sazonais com base no ciclo de plantio. A Bayer recorreu à AWS para obter uma solução mais elástica e econômica para executar sua plataforma.

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Estudo de caso da Icahn School of Medicine

Estudo de caso da Icahn School of Medicine em Mount Sinai

A Icahn School of Medicine at Mount Sinai e a Station X criaram o GenePool, uma plataforma de software de dados genômicos humanos. Com a AWS como base, a plataforma pode dimensionar de forma dinâmica em minutos e armazenar conjuntos de dados para clientes de genômica clínica e translacional.

Leia o estudo de caso completo »

Conceitos básicos da AWS

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