亚马逊AWS官方博客

Tag: 崔向徽

基于 Amazon EKS 在 Pachyderm 框架上 快速搭建 GATK 分析流程

Amazon EKS 简化了 Kubernetes 集群的构建与维护,而 Pachyderm 进一步简化了分析类工作流的运行与管理,两者结合,无疑将使得在 Kubernetes 平台上部署企业级分析平台更为轻松。本文通过一个 GATK 基因分析的示例来演示搭建和使用的过程,为您在 Amazon EKS 上采用该解决方案提供参考。

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基于 AWS Batch 只需五步搭建一个高性能集群

AWS Batch服务近期已在AWS中国区域上线运行。AWS Batch已在全球范围内广泛服务于基因测序、数字媒体渲染、科学研究、金融服务等高性能计算(HPC)的业务场景中。本文通过一个只需五个步骤的动手实践来示例如何利用AWS Batch快速搭建HPC集群,以帮助您快速上手运用AWS Batch服务。

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基于 Lambda + DynamoDB 托管服务构建灵巧型 HPC 集群

在客户运用云端计算集群来处理诸如分子匹配分析或中小规模基因分析的任务时,需要能有一个更轻量级的、可自定义并行规则的集群调度方式,本文提出一种基于 Lambda + DynamoDB 托管服务来构建灵巧型 HPC 集群的应用架构,其中计算集群的调度由 Lambda 函数来串接,分析任务的切片对应关系和各数据片的状态基于 DynamoDB 数据库来存储,同时提供配置和状态查询的API接口。

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